Drop me a thanks if you find it any good and you'll make me happy!
  $dir_id = if of the whole structure (the one you'll call in you jQuery)
  $dir_class...
  $path is the path to scan
  $extension is a filter. I used it to find all my PHP files for instance
  $file_on_click_event. I give you 1 guess

1. function BuildFileList($dir_id, $dir_class = "filetree", $path="", $extension="", $file_on_click_event=""){
2.         if(empty($path))$path    =  $_SERVER['DOCUMENT_ROOT'];
3.         function _BuildFileList($path, $extension, $file_on_click_event=""){
4. /*******************************************************************************
5. *
6. *        Sets events and a bit of initialision
7. *
8. ******************************************************************************/
9.                 $list        = "";
10.                 $dir_handle = @opendir($path) or die("Unable to open $path");
    
    
11.                 while (false !== ($file = readdir($dir_handle))) {
    
    
12. /*******************************************************************************
    
    
13. *
    
    
14. *        It's a directory! Mainly adds the folder header and does a recursion
    
    
15. *
    
    
16. *        **** WILL NOT INCLUDE SVN directories ****
    
    
17. *
    
    
18. ******************************************************************************/
    
    
19.                         if(is_dir("$path/$file")){
    
    
20.                                 if(".."!=$file&&"."!=$file&&".svn"!=$file){
    
    
21.                                         $list        .=        "<li class='closed'>".
    
    
22.                                                                 "<span class='folder'>$file</span>".
    
    
23.                                                                 _BuildFileList("$path/$file", $extension, $file_on_click_event).
    
    
24.                                                                 "</li>";
    
    
25.                                 }
    
    
26.                         }else{
    
    
27. /*******************************************************************************
    
    
28. *
    
29. *        It's a file. Appends
    
30. *
    
31. ******************************************************************************/
    
    
32.                                 if(empty($extension)){
    
    
33.                                         $list    .= "<li><span class='file' onclick='$file_on_click_event' style='cursor:pointer;'>$file</span></li>\n";
    
34.                                 }else{
    
35.                                         $path_parts = pathinfo("$path/$file");
    
36.                                         if(isset($path_parts["extension"])){
    
37.                                                 if($extension==$path_parts["extension"]){
    
38.                                                         $list        .= "<li><span class='file' onclick='$file_on_click_event' style='cursor:pointer;'>$file</span></li>\n";
    
    
39.                                                 }
    
40.                                         }
    
    
41.                                 }
    
42.                         }
    
    
43.                 }
    
44.                 closedir($dir_handle);
    
45.                 return "<ul>$list</ul>";
    
46.         }
    
    
47.         $content    = _BuildFileList($path, $extension, $file_on_click_event);
    
    
48.         return "<ul id='$dir_id' class='$dir_class'><li>$content</li></ul>";
    
    
49. }